Nel tubo di combustione ad alta temperatura, il campione subisce un'ossidazione catalitica ad alta temperatura, convertendo sia il carbonio organico che quello inorganico in anidride carbonica. Nella provetta di reazione a bassa temperatura, il campione viene acidificato e il carbonio inorganico si decompone in anidride carbonica. L'anidride carbonica prodotta in entrambi i tubi di reazione viene quindi trasportata da un gas vettore a un rilevatore di gas a infrarossi non dispersivo (NDIR) per il rilevamento. Ciò consente la misurazione separata del carbonio totale (TC) e del carbonio inorganico (IC) nel campione di acqua. La differenza tra carbonio totale e carbonio inorganico è il carbonio organico totale (TOC), ovvero TOC = TC - IC.
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